{"id":429,"date":"2007-11-23T00:01:16","date_gmt":"2007-11-22T23:01:16","guid":{"rendered":"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=429"},"modified":"2007-11-26T14:13:18","modified_gmt":"2007-11-26T13:13:18","slug":"medline-perfektionskurs-die-pmid-nummer","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ub.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=429","title":{"rendered":"MEDLINE-Perfektionskurs: Die PMID-Nummer"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=326\">von Dr. Josef K\u00f6nig<\/a><\/p>\n<p>Sicherlich ist Ihnen bei der MEDLINE-Recherche schon des \u00f6fteren am Ende des Eintrages die <strong>PMID \u2013 Nummer<\/strong> aufgefallen. Sie ist die k\u00fcrzeste und rascheste Form in MEDLINE einen bestimmten Artikel zu finden.<\/p>\n<p>Um die unten angef\u00fchrte Arbeit in MEDLINE zu finden, gibt es viele M\u00f6glichkeiten, z.B.:<\/p>\n<ul>\n<li>dong a [au] AND crystallization [ti] AND \u201cNat Methods\u201d[Journal:__jrid32338]\u00a0\u00a0\u00a0<\/li>\n<li>dong a [au] AND avvakumov gv [au]<\/li>\n<\/ul>\n<p>Diese Methode ist umst\u00e4ndlich, fehleranf\u00e4llig und es ist nicht garantiert, dass sie ein <em>eindeutiges<\/em> Ergebniss liefert. Denn sobald der Autor <em>Dong A<\/em> in der Zeitschrift <em>NATURE METHODS<\/em> einen weiteren Artikel \u00fcber <em>crystallization<\/em> schreibt, wird man eben mehr als nur diese eine gesuchte Arbeit finden. Damit die Recherche rasch ein eindeutiges Ergebnis liefert, ist lediglich die Eingabe der <strong>PMID-Nummer<\/strong> im Suchfeld n\u00f6tig. <strong>PMID<\/strong> steht f\u00fcr <strong>P<\/strong>ub<strong>M<\/strong>ed Unique <strong>Id<\/strong>entifier. Die folgenden beiden Schreibweisen sind m\u00f6glich. Die zweite Form ist die exakteste, weil sie am Ende noch die Feldbezeichnung <strong>[pmid]<\/strong> anf\u00fchrt und so einen zuf\u00e4lligen Treffer ausschlie\u00dft (es k\u00f6nnte ja im Text des Titels oder des Abstracts die Zahl 17982461 in anderer Bedeutung vorkommen); in der Regel ist diese Exaktheit aber nicht erforderlich und es reicht, einfach die Zahl 17982461 einzugeben und auf GO zu klicken bzw. ENTER zu dr\u00fccken:<\/p>\n<ul>\n<li>17982461<\/li>\n<li>17982461 [pmid]<\/li>\n<\/ul>\n<p>Tippt man \u00fcbrigens mehrere PMIDs, getrennt durch ein Leerzeichen, ein, z.B. \u2026<\/p>\n<ul>\n<li>17982461 17425406<\/li>\n<li>17982461 17425406\u00a0 [pmid]\u00a0<\/li>\n<\/ul>\n<p>\u2026 so erh\u00e4lt man auch mehrere Arbeiten, in diesem Fall zwei. D.h., MEDLINE verbindet die beiden Suchbegriffe mit dem <em>Boole\u2019schen Operator<\/em> <strong>OR<\/strong> und das bedeutet, es wird die Vereinigungsmenge gefunden. (Die genaue Bedeutung der Verk\u00fcpfungsbefehle AND, OR, NOT wird in einem sp\u00e4teren Beitrag besprochen; f\u00fcrs erste braucht man sich nur zu merken, dass OR immer viel ergibt, AND wenig.)<\/p>\n<p>Hier die Beispielsarbeit:<\/p>\n<p>Nat Methods. 2007 Nov 4<\/p>\n<p><strong>In situ proteolysis for protein crystallization and structure determination.<\/strong><\/p>\n<p>Dong A, Xu X, Edwards AM; Midwest Center for Structural Genomics, Chang C, Chruszcz M, Cuff M, Cymborowski M, Leo RD, Egorova O, Evdokimova E, Filippova E, Gu J, Guthrie J, Ignatchenko A, Joachimiak A, Klostermann N, Kim Y, Korniyenko Y, Minor W, Que Q, Savchenko A, Skarina T, Tan K, Yakunin A, Yee A, Yim V, Zhang R, Zheng H; Structural Genomics Consortium, Akutsu M, Arrowsmith C, Avvakumov GV, Bochkarev A, Dahlgren LG, Dhe-Paganon S, Dimov S, Dombrovski L, Finerty P Jr, Flodin S, Flores A, Gr\u00e4slund S, Hammerstr\u00f6m M, Herman MD, Hong BS, Hui R, Johansson I, Liu Y, Nilsson M, Nedyalkova L, Nordlund P, Nyman T, Min J, Ouyang H, Park HW, Qi C, Rabeh W, Shen L, Shen Y, Sukumard D, Tempel W, Tong Y, Tresagues L, Vedadi M, Walker JR, Weigelt J, Welin M, Wu H, Xiao T, Zeng H, Zhu H. Structural Genomics Consortium, University of Toronto, 100 College Street,Toronto, Ontario M5G 1L5, Canada.<\/p>\n<p>We tested the general applicability of in situ proteolysis to form protein crystals suitable for structure determination by adding a protease (chymotrypsin or trypsin) digestion step to crystallization trials of 55 bacterial and 14 human proteins that had proven recalcitrant to our best efforts at crystallization or structure determination. This is a work in progress; so far we determined structures of 9 bacterial proteins and the human aminoimidazole ribonucleotide synthetase (AIRS) domain.<\/p>\n<p><strong>PMID: <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/sites\/entrez?Db=pubmed&amp;Cmd=DetailsSearch&amp;Term=17982461%5Buid%5D&amp;WebEnv=0f4WnjcZdmfbbBlOTGE9lSbCXjRba-zrnJpFiC2pfoi-vekOIE2zWpSiT9bET76zM0N3cYVKbouyc2%40264521C16FD324B0_0006SID&amp;WebEnvRq=1\">17982461<\/a><\/strong><\/p>\n<p><strong>Weitere Blog-Beitr\u00e4ge des Autors:<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=409\">GUIDELINES in der Medizin<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=415\">PATHWAY &#8211; Datenbanken<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=353\">Kann Google-Scholar MEDLINE ersetzen?<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=323\">Literaturdatenbank SCOPUS<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>MEDLINE-Perfektionskurs:<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=379\">Die Autorensuche<\/a><\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>von Dr. Josef K\u00f6nig Sicherlich ist Ihnen bei der MEDLINE-Recherche schon des \u00f6fteren am Ende des Eintrages die PMID \u2013 Nummer aufgefallen. 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