{"id":415,"date":"2007-11-01T11:34:53","date_gmt":"2007-11-01T10:34:53","guid":{"rendered":"https:\/\/ub-blog.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=415"},"modified":"2007-11-06T11:24:25","modified_gmt":"2007-11-06T10:24:25","slug":"pathway-datenbanken","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ub.meduniwien.ac.at\/blog\/?p=415","title":{"rendered":"PATHWAY – Datenbanken"},"content":{"rendered":"

von Dr. Josef K\u00f6nig<\/a>\u00a0<\/strong><\/font><\/p>\n

Systems biology<\/strong>, eine etwa um das Jahr 2000 entstandene Fachrichtung der Biologie, bem\u00fcht sich um\u00a0ein Verst\u00e4ndnis der komplexen Interaktionen in biologischen Systemen. <\/em>Dabei werden systematisch untersucht: Transcriptom, Proteom, Metabolom, Glycomics, Interactomics, Fluxomics. Der Darstellung der inter- und intrazellularen Signalkaskaden widmen sich PATHWAY-Datenbanken<\/strong>:<\/font><\/p>\n

Pathway Interaction Database<\/strong>\u00a0<\/font><\/p>\n

In einer Zusammenarbeit zwischen dem NCI<\/a> (National Cancer Institute) und der NPG<\/a> (Nature Publishing Group) entstand die frei zug\u00e4ngliche Datenbank Pathway Interaction Database<\/strong><\/a>. Sie integriert auch Pathways aus der Datenbank BioCarta<\/a> (die dort allerdings graphisch ansprechender\u00a0abgebildet sind).<\/font><\/p>\n

Zur\u00a0Anzeige der Pathways im Internet Explorer wird ein SVG (Scaleable Vector Graphics) – Viewer\u00a0 ben\u00f6tigt, den Sie hier<\/a> finden.<\/font><\/p>\n

BioCarta<\/strong><\/font><\/p>\n

Die eben erw\u00e4hnte Firma BioCarta<\/strong><\/a> stellt ebenfalls Pathways<\/strong><\/a> frei zur Verf\u00fcgung.<\/font><\/p>\n

Protein Lounge<\/strong><\/font><\/p>\n

Leider nicht frei erh\u00e4ltlich sind die Pathways der Protein Lounge<\/strong><\/a>. Diese Quelle bietet die graphisch ansprechendsten Darstellungen der Systembiologie. Unter dem Punkt Bio-Tools<\/a> findet sich der Pathway Builder<\/strong><\/a>, ein Programm, in dem selbst Pathways\u00a0gestaltet werden k\u00f6nnen. Dies kann man mit eingeschr\u00e4nkten M\u00f6glichkeiten auch direkt auf der Homepage kostenlos ausprobieren. Sollte Sie an dieser, im \u00fcbrigen nicht allzu teuren Datenbank Interesse haben, wenden Sie sich bitte an die Universit\u00e4tsbibliothek der MUW.<\/font><\/p>\n

MEDDB<\/strong><\/font><\/p>\n

Eine Zusammenstellung weiterer Pathway-Datenbanken finden Sie auf meiner Datenbankseite<\/strong> www.meddb.info\/<\/a><\/font><\/p>\n

Weitere Blog-Beitr\u00e4ge des Autors:<\/strong><\/font><\/p>\n